曾四度闯关失败的吾尔开希认为，中国政府可能觉得吴亚林这个人不够重要，肯定不是政策松绑。
吾尔开希质疑说：“一个在台湾申请（长期居留）专案，显然他是在专案申请过程中，他是表达自己是有危险的人，结果他自己又回去又出来，这样的一个人，他本身的道德思路，我已经开始有相当的怀疑了，他的讲话不足以当作任何证据。”
寻求政治庇护滞台的中国异议人士龚与剑也以“不可理喻”形容，认为此案对滞台民运人士冲击太大，因为在他的概念中，真、假民运的判准，就是看能不能平安回到中国？为什么吾尔开希闯关多次都失败？
龚与剑还质疑“追溯期已过”的说法荒谬！他说：“吴亚林自己说他是公安的A级逃犯，所谓的颠覆国家政权罪的话，如果说确定犯罪嫌疑人是他的话，就算是你在海外躲三十年、五十年、七十年也好，甚至老死也好，这个追溯期不会消失。”
龚与剑表示，思念家乡是人之常情，吴亚林能勇敢回去平安归台替他欣慰，但吴亚林声称进入大陆近2个月没受到任何骚扰，也未被要求写悔过书，加上归台后将原住处、手机门号全换掉，很不寻常，呼吁台湾政府了解来龙去脉。
近日写公开信给蔡英文总统请求勿遣返他的“民国派”青年王睿不平表示，吴亚林能专案获准政治庇护，为什么他不能？按常理，若他取得庇护，绝不会拿命进中国赌注，尤其现在是八九民运后最高压的时候。王睿说：“共产党已经把手伸向海外，把海外的异议人士都要往回抓了，不可能是开放的表现。”王睿分析，共产党也可能借此统战，制造异议人士回去也没事的假象，想骗更多异议人士回去。
王睿对台湾立法院审议中的难民法提建言：“应该签一个承诺条款，就像现在美国制定一个取得政治庇护的人，是不可以回到受迫害的母国，如果你回到受迫害的母国，你的绿卡就立即取消。”
与吴亚林同一批申请专案的陈荣利则认为吴亚林离开家乡近十年，冒险回去想见亲人一面，心情可以理解，很多海外民运人士都希望自己能够回去。陈荣利叹了一口气说：“唉，我觉得如果用这种理由谴责，这个太过份了，就是说已经超出了人情的范围之内。”
陈荣利表示，回家是人权，难民法不该对此限制，民主人士能平安归台当然是好事，但这是个案，还没看到第二个案例，值得观察。他认为民主人士的身分当然是真的，否则台湾政府也不会给他政治庇护。
针对外界质疑，吴亚林气愤反问难道他在大陆坐了九年监狱是假的吗？吴亚林13日只愿透过通讯软体回应说，吾尔开希是全大陆都知道的六四领袖，当然回不去。至于改门号是因为过去借他人身分证才能办号码。吴亚林随即提供记者他新办的电话号码，强调一切坦荡可接受检验，欢迎任何单位调查。台湾政府则表示，正在对此案进行了解中。
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